CERBA MEDIC – 04 | 23
L’exoma
L’anàlisi de l’exoma permet identificar variacions en una gran varietat de trastorns genètics.
El 85% de les variacions que causen malalties es troben en l’exoma, per la qual cosa la seva anàlisi cobra gran importància en la lluita contra malalties genètiques. El seu estudi és molt rellevant ja que és una de les formes més completes d’estudiar l’ADN humà.
L’exoma humà
Que conté la informació que codifica les proteïnes, constitueix entre l’u i el dos per cent del genoma total. Els errors en aquestes regions del genoma són, amb diferència, els que més contribueixen a les malalties mendelianes (Chong et al, 2015) i a les malalties clonals adquirides, com el càncer.
La seqüenciació de l’exoma clínic (CES, per les seves sigles en anglès) comprèn les regions exòniques que solapen amb regions que alberguen mutacions causants de malalties, basat en les bases de dades “Human Gene Mutation Disease” (HGMD) (Stenson et al, 2020) i “En línia Mendelian Inheritance in Man” (OMIM) (Amberger et al, 2015). És fonamental per a la determinació de les causes genètiques de múltiples malalties.
L’anàlisi de l’exoma permet analitzar tots els gens d’un individu
És utilizat per a:
Obtenir informació de tots aquells gens coneguts relacionats amb una determinada patologia.
S’incrementa de manera molt significativa la probabilitat d’identificar una mutació causant d’una malaltia d’aquests gens.
Indicat en uns certs casos de càncer, cardiopaties, malalties neurodegeneratives, distròfies musculars, epilèpsies o retard idiopàtic.
Aquells casos en els quals els símptomes no es poden associar a un diagnòstic clar.
L’anàlisi de tots els gens d’un individu suposa una solució ràpida i alhora rendible per a obtenir un diagnòstic.
Indicat en el cas de malalties rares i complexes amb sospita de ser causades per mutacions de novo o recessives.
NGS: Alta sensibilitat i especificitat
Equip Illumina tecnologia NGS de Cerba.
La seqüenciació de nova generació (Next Generation Sequencing [NGS])
És un grup de tecnologies dissenyades per a seqüenciar gran quantitat de fragments d’ADN de manera massiva i en paral·lel, en menys temps i a un cost inferior per base que els mètodes tradicionals de seqüenciació (Sanger).
Gràcies al desenvolupament en les proves basades en NGS, aquesta tecnologia es planteja com una estratègia de gran utilitat per a la prevenció, diagnòstic, tractament i seguiment d’un ampli espectre de malalties, incloses condicions genètiques i patologies cròniques.
NGS i el Trastorn d’Espectre Autista (TEA)
La discapacitat intel·lectual (DIGUES) engloba un grup clínic i genèticament heterogeni de trastorns del neurodesenvolupament sovint associats al trastorn d’espectre autista (TEA).
Tenint en compte l’extrema heterogeneïtat dels locus genètics, els mètodes de seqüenciació de nova generació (NGS) han proporcionat potents eines per a la identificació de gens candidats.
El diagnòstic molecular és crucial per a millorar els resultats, prevenir complicacions i poder iniciar un enfocament terapèutic.
Fins al 50% dels pacients amb ID/*TEA romanen sense un diagnòstic molecular. Les tecnologies de seqüenciació de nova generació (NGS) han millorat enormement les possibilitats d’identificar gens responsables tant coneguts com nous.
L’ús de la seqüenciació de l’exoma clínic (CES) juntament amb l’anàlisi de les CNV pot identificar una variant patogènica en aproximadament el 30% dels pacients (Bruno et al, 2021).
Els rendiments diagnòstics actuals suggereixen l’aplicació de la CES com a prova diagnòstica rutinària de primer nivell que permet un diagnòstic precoç per als pacients amb ID/*TEA, amb una millora en termes de qualitat de vida de les famílies afectades.
